MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 7521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017065	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017065	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017065	TGT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017065	TTG	2	6	939	944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017065	GTT	2	6	1018	1023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017065	ATTT	2	8	1401	1408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017065	GTT	2	6	6062	6067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017065	T	7	7	6328	6334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017065	TCC	2	6	6606	6611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017065	TAAA	2	8	6655	6662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017065	TCT	2	6	7915	7920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017065	AAT	2	6	7948	7953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017065	T	7	7	8002	8008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017065	GCT	2	6	8030	8035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017065	GAC	2	6	8042	8047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017065	CAA	3	9	8061	8069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017065	TA	3	6	9162	9167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017065	TAT	2	6	9179	9184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017065	CAA	2	6	9186	9191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017065	ATG	2	6	9230	9235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017065	AGC	2	6	9247	9252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017065	ATA	2	6	9279	9284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017065	CAA	2	6	9354	9359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017065	A	7	7	9385	9391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017065	AAG	2	6	9429	9434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017065	AATTA	2	10	9435	9444	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017065	AT	3	6	9445	9450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017065	T	6	6	9459	9464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017065	T	6	6	9483	9488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017065	TAA	2	6	9541	9546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017065	TAA	2	6	9559	9564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017065	TAA	2	6	9807	9812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017065	AGA	2	6	9891	9896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017065	A	6	6	9967	9972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017065	GT	3	6	9993	9998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017065	TGA	2	6	10049	10054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017065	TA	3	6	10094	10099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017065	A	6	6	10120	10125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017065	AGT	2	6	10136	10141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017065	TGG	2	6	10155	10160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017065	AAT	2	6	10168	10173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017065	TGA	2	6	10191	10196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017065	GCA	2	6	10204	10209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017065	CCTC	2	8	10215	10222	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_017065	ATA	2	6	10229	10234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017065	CAAT	2	8	10262	10269	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017065	TAC	3	9	10323	10331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017065	TGT	2	6	10332	10337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017065	GTT	2	6	10388	10393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017065	TGA	2	6	10418	10423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017065	ATA	2	6	10426	10431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017065	AAG	2	6	10468	10473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017065	TAA	2	6	10477	10482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017065	TAT	2	6	10578	10583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017065	AAC	2	6	10584	10589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017065	TTG	2	6	10692	10697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017065	AAT	2	6	10787	10792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017065	ATC	2	6	10823	10828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017065	GTT	2	6	10843	10848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017065	GTA	2	6	10930	10935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017065	ACT	2	6	10976	10981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017065	TTG	2	6	10991	10996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017065	CTT	2	6	11041	11046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017065	TAC	2	6	11253	11258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017065	ATTA	2	8	11261	11268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017065	AAC	2	6	11316	11321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017065	ATT	2	6	11354	11359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017065	TAT	2	6	11370	11375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017065	T	6	6	11393	11398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017065	ATTA	2	8	11475	11482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017065	A	6	6	11487	11492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017065	TGG	2	6	11531	11536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017065	GAATT	2	10	11563	11572	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017065	AGA	2	6	11632	11637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017065	T	6	6	11683	11688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017065	CAT	2	6	11708	11713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017065	TTA	2	6	11747	11752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017065	ATA	2	6	11823	11828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017065	A	6	6	11865	11870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017065	T	6	6	12027	12032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017065	A	7	7	12060	12066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017065	A	6	6	12086	12091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017065	TTTA	2	8	12094	12101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017065	T	7	7	12115	12121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017065	AAT	2	6	12146	12151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017065	ATT	2	6	12208	12213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017065	AAT	2	6	12223	12228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017065	GCA	2	6	12240	12245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017065	TAA	2	6	12249	12254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017065	GCT	2	6	12266	12271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017065	T	6	6	12280	12285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017065	CTT	2	6	12480	12485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017065	AGC	2	6	12499	12504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017065	GATT	2	8	12536	12543	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017065	AAAT	2	8	12544	12551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017065	T	6	6	12557	12562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017065	AATT	2	8	12571	12578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017065	CTT	2	6	12585	12590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017065	T	6	6	12589	12594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017065	AC	3	6	12617	12622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017065	TA	3	6	12654	12659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017065	TTC	2	6	12673	12678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017065	T	7	7	12708	12714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017065	TTA	2	6	12738	12743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017065	TTAA	2	8	12752	12759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017065	GTG	2	6	12837	12842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017065	TA	3	6	12915	12920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017065	TCG	2	6	12945	12950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017065	CGCTC	2	10	12987	12996	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_017065	TTA	2	6	13057	13062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017065	TTAG	2	8	15125	15132	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017065	TAA	2	6	15137	15142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017065	GTT	2	6	15158	15163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017065	GAA	2	6	15176	15181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017065	TAACT	2	10	15375	15384	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017065	TAG	2	6	15389	15394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017065	A	6	6	15448	15453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017065	TTG	2	6	18257	18262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017065	TG	3	6	18261	18266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017065	ATA	2	6	18319	18324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017065	A	7	7	18324	18330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017065	T	6	6	18346	18351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017065	GAC	2	6	18393	18398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017065	CA	3	6	18407	18412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017065	A	6	6	18444	18449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017065	TTA	2	6	18453	18458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017065	TTA	2	6	18463	18468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017065	TTA	2	6	18537	18542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017065	T	6	6	18550	18555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017065	A	6	6	18822	18827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017065	A	6	6	18835	18840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017065	ATT	2	6	19613	19618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017065	GATA	2	8	19797	19804	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017065	GTA	2	6	19834	19839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017065	AGCA	2	8	19865	19872	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017065	TA	3	6	19904	19909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017065	T	6	6	19910	19915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017065	T	6	6	19927	19932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017065	T	6	6	19956	19961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017065	TAC	2	6	19981	19986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017065	AGTA	2	8	20130	20137	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017065	AT	3	6	20148	20153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017065	AAAC	2	8	20180	20187	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017065	A	6	6	20190	20195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017065	A	7	7	20198	20204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017065	TTG	2	6	20205	20210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017065	AAT	2	6	20245	20250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017065	TAAA	2	8	20256	20263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017065	ATT	2	6	20288	20293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017065	GTT	2	6	20310	20315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017065	TA	4	8	20358	20365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017065	AAT	2	6	20380	20385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017065	TA	3	6	20430	20435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017065	TTAT	2	8	20451	20458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017065	TTTAA	2	10	20488	20497	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017065	TA	3	6	26369	26374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_017065	TAC	2	6	26704	26709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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166	NC_017065	TAA	2	6	27094	27099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017065	TTA	2	6	27112	27117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_017065	AAATA	2	10	28516	28525	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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228	NC_017065	AT	3	6	38172	38177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
229	NC_017065	T	6	6	38229	38234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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